Mit seiner Bestellung als Mitglied der Geschäftsleitung im März 2001 übernahm Gisler das Ressort Clearing. Unter seiner Verantwortung implementierte Eurex Clearing den Zentralen Kontrahenten für den Aktienhandel an der Börse Frankfurt und der Irish Stock Exchange sowie für Fixed Income-Produkte an Eurex Bonds und Eurex Repo. Außerdem fällt in diese Zeit der Aufbau der transatlantischen Clearing-Lösung Global Clearing Link zwischen Eurex Clearing und dem amerikanischen Clearinghaus The Clearing Corporation. Als Verantwortlicher für das Eurex Clearinghaus hat Daniel Gisler dessen Ausbau und die Weiterentwicklung massgeblich geprägt und die Effizienz weiter gesteigert.
Gisler kam von der SWX Swiss Exchange, die neben der Deutschen Börse Muttergesellschaft der Eurex ist. Bereits in den Jahren 1997 und 1998 war er beim Zusammenschluss von DTB Deutsche Terminbörse und SOFFEX Projektleiter Produkte und Funktionalität. Unmittelbar vor seinem Wechsel zu Eurex war er bei der SWX verantwortlich für die Umsetzung des Projekts virt-x im Bereich Clearing und Settlement, davor war er Projektleiter und Produktmanager für den elektronischen Repo-Markt in der Schweiz.
Andreas Preuss, CEO von Eurex und Mitglied des Vorstands der Deutschen Börse, und Jürg Spillmann, stellvertretender CEO von Eurex und Vorsitzender der SWX-Gruppenleitung, dankten Gisler: „Daniel Gisler war maßgeblich beteiligt an der Weiterentwicklung von Eurex sowie an der Ausrichtung von Eurex Clearing. Wir danken Daniel Gisler für sein ausserordentliches, persönliches und erfolgreiches Engagement für die Unternehmensgruppe.“