Innovative Heiz- und Speicher-Systeme sind dabei wichtige Schwerpunkte des Programms. Dafür stellt der Freistaat 90 Mio. Euro zur Verfügung. Zielgruppe sind Eigentümer und Bauherren selbstgenutzter Ein- und Zweifamilienhäuser. Die Förderung beträgt zwischen 1.000 und 18.000 Euro. Das Bayerische Förderprogramm wird grundsätzlich nicht zu einer Kürzung bestehender Fördermittel führen. Vielmehr wurde das Programm mit Kfw- und BAFA-Mittel abgestimmt.
Das 10.000-Häuser-Programm bietet zwei unterschiedliche Förderbereiche an: Im Programmteil Heizungstausch soll der Austausch alter ineffizienter Heizkessel gegen eine neue Wärmeversorgung unterstützt werden. Im Programmteil EnergieSystemHaus werden innovative und intelligente Heiz-/Speicher-Systeme, Photovoltaik und Batteriespeicher sowie Solarthermie gefördert.