PCR-basierte Genanalysen können nur dann im großen Maßstab durchgeführt werden, wenn Signalerzeugung, Signalerfassung und Signalauswertung hochreproduzierbar ablaufen. Temperatursteuerung, optische Signalerfassung und die Algorithmen, die zur qualitativen und quantitativen Charakterisierung der Gene verwendet werden, müssen hochpräzise und verlässlich sein. Das neue LightCycler® 1536-System von Roche Applied Science erfüllt all diese Anforderungen. Die Plattform nutzt eine spezielle 1536-Well-Platte und bietet so die Möglichkeit, besonders schnelle DNA- und RNA-Analysen auf qPCR-Basis in einem Array-ähnlichen Format durchzuführen.
Dazu Manfred Baier, Leiter von Roche Applied Science: "Durch Erhöhung des qPCR-Durchsatzes bei gleichzeitiger Miniaturisierung der Einzelreaktionen haben wir die nächste Generation eines leistungsfähigen Systems zur Nukleinsäureanalyse entwickelt, das die Stärken der qPCR mit dem parallelen Ansatz und den Durchsatzvorteilen von Low-Density-Microarrays verbindet."
Das Gerät basiert auf der etablierten LightCycler® 480-Plattform. Es enthält ein neues Thermocycler-Modul, das speziell für die Temperatursteuerung der 1536 einzelnen qPCR-Reaktionsmischungen in der Multiwell-Platte entwickelt wurde. Der LightCycler® 1536 unterstützt die Kombination von zwei Anregungsfiltern mit zwei Emissionsfiltern, die für die Detektion von interkalierenden grünen Farbstoffen sowie von ein- oder zweifarbigen Hydrolysesonden optimiert wurden. Die optische Signalerfassung erreicht so die höchste mit chemischen Detektionsverfahren erreichbare Spezifität und der experimentelle Aufbau für Hochdurchsatzexperimente wird weniger komplex.
Über das Hauptsoftwaremodul des neuen Systems können Reaktionsprotokolle einfach programmiert und gestartet werden. Die Software des LightCycler® 1536 ist im Vergleich zur Software der klassischen LightCycler® Systeme besonders geeignet für automatische Datenanalysen in Hochdurchsatzanwendungen.
Die Multiwell-Platte des LightCycler® 1536 ist die erste hochdichte PCR-Platte für Real-Time-PCR-Anwendungen. In diesem einzigartigen Multiwell-Format, das von IT-IS International Ltd. entwickelt wurde, werden mit Hilfe der Thermaxis®-Technologie hervorragende Temperaturergebnisse in miniaturisierten Reaktionsvolumina von nur 0,5-2 µl erzielt. Die Platte besteht aus zwei Teilen: einer temperaturleitenden Einheit mit Well-ähnlichen Strukturen für die Reaktionslösungen und einer isolierenden Schicht darüber, die verhindert, dass der beheizte Deckel des Geräts die Analyse beeinflusst.
Eine wichtige Entwicklung der biologischen und biochemischen Analytik in den vergangenen 15 Jahren war die Miniaturisierung und Parallelisierung analytischer Verfahren. Hochdurchsatzverfahren für die Genexpressionsanalyse oder für die Untersuchung genetischer Polymorphismen sind ein entscheidendes Element der modernen funktionellen Genomforschung, bei der Einzelproben auf viele tausend Zielgene untersucht werden. Die hohe Empfindlichkeit und Genauigkeit machen die qPCR zum etablierten Goldstandard, wenn es um präzise Genexpressionsprofile oder die Genotypisierung bekannter SNPs geht.
Dazu Manfred Baier, Leiter von Roche Applied Science: "Durch Erhöhung des qPCR-Durchsatzes bei gleichzeitiger Miniaturisierung der Einzelreaktionen haben wir die nächste Generation eines leistungsfähigen Systems zur Nukleinsäureanalyse entwickelt, das die Stärken der qPCR mit dem parallelen Ansatz und den Durchsatzvorteilen von Low-Density-Microarrays verbindet."
Das Gerät basiert auf der etablierten LightCycler® 480-Plattform. Es enthält ein neues Thermocycler-Modul, das speziell für die Temperatursteuerung der 1536 einzelnen qPCR-Reaktionsmischungen in der Multiwell-Platte entwickelt wurde. Der LightCycler® 1536 unterstützt die Kombination von zwei Anregungsfiltern mit zwei Emissionsfiltern, die für die Detektion von interkalierenden grünen Farbstoffen sowie von ein- oder zweifarbigen Hydrolysesonden optimiert wurden. Die optische Signalerfassung erreicht so die höchste mit chemischen Detektionsverfahren erreichbare Spezifität und der experimentelle Aufbau für Hochdurchsatzexperimente wird weniger komplex.
Über das Hauptsoftwaremodul des neuen Systems können Reaktionsprotokolle einfach programmiert und gestartet werden. Die Software des LightCycler® 1536 ist im Vergleich zur Software der klassischen LightCycler® Systeme besonders geeignet für automatische Datenanalysen in Hochdurchsatzanwendungen.
Die Multiwell-Platte des LightCycler® 1536 ist die erste hochdichte PCR-Platte für Real-Time-PCR-Anwendungen. In diesem einzigartigen Multiwell-Format, das von IT-IS International Ltd. entwickelt wurde, werden mit Hilfe der Thermaxis®-Technologie hervorragende Temperaturergebnisse in miniaturisierten Reaktionsvolumina von nur 0,5-2 µl erzielt. Die Platte besteht aus zwei Teilen: einer temperaturleitenden Einheit mit Well-ähnlichen Strukturen für die Reaktionslösungen und einer isolierenden Schicht darüber, die verhindert, dass der beheizte Deckel des Geräts die Analyse beeinflusst.
Eine wichtige Entwicklung der biologischen und biochemischen Analytik in den vergangenen 15 Jahren war die Miniaturisierung und Parallelisierung analytischer Verfahren. Hochdurchsatzverfahren für die Genexpressionsanalyse oder für die Untersuchung genetischer Polymorphismen sind ein entscheidendes Element der modernen funktionellen Genomforschung, bei der Einzelproben auf viele tausend Zielgene untersucht werden. Die hohe Empfindlichkeit und Genauigkeit machen die qPCR zum etablierten Goldstandard, wenn es um präzise Genexpressionsprofile oder die Genotypisierung bekannter SNPs geht.
